公交候车亭的建设通常由 当地交通局、公交公司、建设局、市政管理局、城投公司或政府指定的经营管理单位负责。具体负责单位可能因城市而异，但主要涉及以下几个部门：

当地交通局：

负责公交候车亭的规划、建设和管理，通常会与公交公司一起牵头实施项目。

公交公司：

作为使用单位，公交公司通常负责提供可行性建设报告，并根据市政府的相关规定进行候车亭的建设和经营管理。

建设局：

有些城市的公交候车亭建设由建设局负责，尤其是涉及基础设施建设的部分。

市政管理局：

有些城市的市政管理局也参与公交候车亭的建设和管理。

城投公司：

有些城市的城投公司负责公交候车亭的建设和管理，尤其是在需要大量资金投入的情况下。

政府指定的经营管理单位：

有些城市会设立专门的经营管理单位，负责公交候车亭的投资、建设、经营管理等工作。

建议在具体项目中，相关负责单位应协同合作，确保候车亭的顺利建设和使用。